德國漢堡市——2011年6月22日[國際超級電腦大會,展位850號]下一代共享資料分散平台供應商Fusion-io (NYSE: FIO)日前在德國的超級計算大會上宣布,在聖地牙哥加州福尼亞大學Fusion-io同聖地牙哥超級電腦中心(SDSC)合作進行的Protein Data Bank(PDB)研究中,Fusion-io的技術用在生物資訊領域,實現了MySQL資料庫查詢效能的顯著提升。SDSC的研究人員表示,在他們的資料庫基礎設施上使用Fusion-io技術取代硬碟(HDDs)之後,資料庫的查詢時間從30分鐘縮短到3分鐘。
SDSC是一家美國聖地牙哥加州大學的一個調研機構,該機構將Fusion的 ioMemory技術用於其資料密集型計算。作為這一舉措的一部分,研究人員正使用該技術來推進Protein Data Bank的研究,這是世界上最大的存儲大型分子和核酸三維結構的儲存庫。該研究的實施能夠加快救生藥物用於藥物和對疾病的其它療效的開發。
SDSC的Allan Snavely表示:「由於SDSC致力於成為具有卓越研究成果的研發中心,所以我們更注重評估基於快閃記憶體的技術如何改進科學探索。通過研究,我們發現Fusion-io所提供的存儲產品比硬碟的處理速度更快,能夠滿足很多大容量記憶體和密集型資料的處理需求,並且基於快閃記憶體的存儲記憶體能夠實現超高的計算效能。」
使用部署了Fusion技術的伺服器,研究人員能夠縮短複雜的MySQL資料庫的查詢時間,而這能夠確定蛋白質和目標蛋白質相互作用的關係。使用傳統的硬碟,對超過2億個蛋白質結構的一次查詢分析要花費30分鐘的時間。
SDSC計算科學家和Gordon Applications 的負責人Robert Sinkovits表示:「採用Fusion的共享資料分散技術,存儲記憶體介質就能夠恰好位於處理器的附近,從而極大地降低了延遲並提高了處理速度,處理上述同樣的查詢只花費3分鐘。」
與Allen Snavely一起開展研究工作的Spencer Bliven(畢業於加州大學聖地牙哥分校的生物資訊學和系統生物學學院)表示,「PBD幫助我們對生物科學的基礎課程獲得了更加理論和實際地認識和理解。在測試中我看到,使用Fusion的ioMemory技術大大減少了查詢時間,這樣我就能夠將精力更多的關注於研究。這就使得科學探索的過程更加具有自發性,並且有助於我們顯著消除潛在的錯誤。」
用於實現效能提升的電腦包含兩個四核Intel Xeon E5530 2.40 GHz處理器和48 GB的DDR3-1066記憶體。安裝有4個320 GB的ioDrives和配置了運行XFS檔案系統的單個1.2 TB RAID 0設備。
Fusion-io的首席技術官Neil Carson表示:「將關鍵資料存儲到處理這些資料的伺服器上能夠極大的提升大型資料集的分析,從而促進新的科學探索。我們很高興,SDSC利用Fusion-io的技術顯著提升了效能和降低延遲,從而推進了複雜的生物研究。」
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關於Fusion-io
Fusion-io是新一代共享資料分散化專用存儲類記憶體平台的開拓企業,該平台可以透過將過程關鍵型或「活躍」資料從集中存儲遷移至正在進行處理的伺服器,大大提高資料中心內的處理功能,該方法被稱為「資料分散化」。Fusion提供的硬體、軟體整合解決方案利用非揮發性記憶體,大大提高資料中心的效率,並提供企業級效能、可靠性、可用性和可管理性。Fusion的資料分散平台可以將傳統架構轉化為新一代的資料中心,並能夠讓企業整合或大幅削減複雜且昂貴的高效能存儲、高效能網路和大記憶體容量的伺服器。Fusion平台能夠讓企業提高其資料中心資源的利用率、效能和效率並從其資訊資產中獲取更多的價值。